Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01757 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01757 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01757 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01757 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01757 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01757 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01757 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01757 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01757 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01757 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms