Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01672 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01672 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01672 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01672 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01672 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms