Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ccl20O89093 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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