Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ComtO88587 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ComtO88587 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms