Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capns1O88456 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms