Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms