Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CaskO70589 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CaskO70589 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CaskO70589 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CaskO70589 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CaskO70589 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CaskO70589 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CaskO70589 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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