Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtssO70370 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtssO70370 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtssO70370 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtssO70370 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms