Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Top3aO70157 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3aO70157 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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