Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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HcrtO55241 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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HcrtO55241 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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HcrtO55241 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HcrtO55241 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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