Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BckdkO55028 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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