Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E2f6O54917 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms