Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkaO54804 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChkaO54804 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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