Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DffaO54786 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DffaO54786 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DffaO54786 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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