Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Limk2O54785 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limk2O54785 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Limk2O54785 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Limk2O54785 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Limk2O54785 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limk2O54785 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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