Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc4O35988 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms