Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FxnO35943 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FxnO35943 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FxnO35943 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FxnO35943 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FxnO35943 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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