Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Nek2O35942 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek2O35942 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms