Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms