Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CaluO35887 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CaluO35887 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms