Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npc1O35604 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npc1O35604 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms