Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc1a6O35544 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms