Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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