Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xbp1O35426 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Xbp1O35426 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms