Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna4O35343 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms