Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ptpn9O35239 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn9O35239 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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