Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1aO35134 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms