Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Scarb2O35114 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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