Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn4O35054 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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