Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Q1O19441 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Q1O19441 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Q1O19441 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Q1O19441 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms