Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcm2O09102 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms