Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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