Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms