Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MsmbO08540 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MsmbO08540 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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