Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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