Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700122O11RikJ3QPW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms