Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm5294J3QP53 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm5294J3QP53 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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