Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim18J3QNP2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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