Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Zfp616J3QN14 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp616J3QN14 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp616J3QN14 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms