Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6594J3QM43 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6594J3QM43 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms