Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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