Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms