Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms