Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-1G3UXB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms