Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34aG3UW52 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms