Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl26F8VQM2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms