Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms