Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms