Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms