Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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